Системы и синтетическая биология

Программа MRes в Институте систем и синтетической биологии организована совместно с Национальным центром синтетической биологии и инноваций EPSRC (CSynBI) и Центром биологии и биоинформатики интегральных систем (CISBIO).

Курс предоставляет аспирантам наук о жизни, инженерных и физических наук платформу для преодоления традиционных барьеров для совместной работы над «большими проблемами» и приложениями в синтетической и системной биологии. Студенты получают интенсивный практический опыт в комбинации экспериментальной биологии и моделирования, чтобы понять, предсказать и перепроектировать биологические пути. Существует связь с Центром BIOS в Королевском колледже, чтобы облегчить интеграцию этого исследования с возникающими этическими, правовыми и социальными проблемами.

Преподаваемые элементы курса включают вводные модули, которые охватывают основы как для жизни, так и для физических ученых, а также модули по экспериментальной системной биологии, теоретической системной биологии, синтетической биологии и передовым технологиям. В дополнение к обычным лекциям, курс требует активного участия студентов посредством практических занятий, стендовой работы, тематических исследований, написания предложений, журнальных клубов и восьмимесячного междисциплинарного исследовательского проекта. Только эти действия будут отмечены; не будет никаких официальных письменных экзаменов.

Для дальнейшего обогащения программы будут обеспечены тесные связи с промышленностью и медициной в рамках исследовательских проектов соответствующих членов Института, а также дополнительных курсов и семинаров.

Программа предлагается только в качестве очного одногодичного курса и ведет к получению степени MRes. Студенты начинают свою лекционную программу с обязательных основных курсов и практических занятий (модули 1–5) в первый семестр (октябрь – декабрь).

В январе студенты выбирают тему для восьмимесячного междисциплинарного, теоретического или экспериментального исследовательского проекта под руководством по крайней мере двух руководителей с различным опытом. Один руководитель также может быть из отрасли.

В течение января студенты пишут исследовательское предложение (6 страниц) по выбранному ими исследовательскому проекту, которое оценивается студенческой фиктивной панелью для ранней обратной связи перед отправкой руководителям. В течение сроков 2 (январь-март) и 3 (апрель-июнь) будет организована мини-конференция.

Этот краткий курс лекций знакомит с основами моделирования и теоретического анализа, ориентированными на студентов из естественных наук с ограниченным теоретическим образованием. В частности, лекции будут охватывать дифференциальные уравнения и стохастическое моделирование.

Компьютер практичен - будет представлен программный пакет Matlab. Акцент будет сделан на обучении на примерах. Студенты узнают, как читать файлы данных, анализировать данные, подгонять модели к данным, строить графики, печатать в выходные файлы и как реализовывать простые динамические модели. Последний будет сосредоточен на обыкновенных дифференциальных уравнениях.

Этот краткий курс лекций / инструкторов предоставит введение в естественные науки, ориентированное на студентов, изучающих физические науки. В лекциях будут обсуждаться аспекты молекулярной биологии и обмена информацией в биологическом контексте (ДНК, РНК, белки, транскрипция и трансляция). Будет дан обзор некоторых экспериментальных методов (клонирование, ПЦР).

В дополнение к базовому введению в биологию, будет дано представление о современных методах сборки ДНК, которые имеют применение в синтетической биологии и будут интересны для студентов с жизненным образованием.

Будет предоставлен практический опыт в основных экспериментальных методах. Практик будет изучать новые методы сборки ДНК.

Модуль 2 - Экспериментальная системная биология

Лекции будут охватывать сигнальные и генные регуляторные пути и программы для бактерий, клеток млекопитающих и растений. Дальнейшие темы лекций будут включать структурную и функциональную геномику и экспериментальные методы. Молекулярная медицина и генетические аспекты здоровья и болезней также будут упомянуты.

Модуль 3 - Теоретическая системная биология

Этот курс лекции будет охватывать различные методы моделирования. В частности, лекции будут охватывать динамические системы, сети, детерминированные дифференциальные уравнения, стохастическое моделирование, теорию управления, биофизику и механику клетки, а также статистические подходы, такие как байесовский вывод.

Модуль 4 - Синтетическая биология

Темы модуля варьируются от биологических строительных блоков и их характеристики, например, отношения ввода / вывода, фильтры, усилители, надежность, а также теория управления, анализ метаболического потока и генная инженерия. Кроме того, в этом модуле будут рассмотрены социальные, этические и политические вопросы, такие как связь науки с обществом, биология в политическом контексте, социальные проблемы, управление и регулирование.

Модуль 5 - Передовые технологии

Этот краткий курс лекций охватит технологии обработки изображений и высокопроизводительные технологии. Методы визуализации включают различные формы флуоресцентной микроскопии, а высокопроизводительные методы включают экраны RNAi, микрочипы и микрофлюидные устройства.

Минимальная квалификация для поступления - это, как минимум, диплом с отличием высшего второго класса по физическим, инженерным, математическим или биомедицинским предметам из академического учреждения Великобритании или эквивалентная зарубежная квалификация. Математика уровня A, как правило, требуется для поступления.

Если ваша первая ученая степень не из Великобритании, вам могут пригодиться рекомендации в нашем Страновом индексе. Обратите внимание, что в этих рекомендациях указан минимум колледжа. Наше требование обычно выше.

Математика уровня A (или эквивалентная) обычно требуется для поступления.