Вычислительной биологии и молекулярной биофизики

Описание

Реклама

Институт количественной биологии BioMaPS является междисциплинарным исследовательским институтом при университете Рутгерса. состоит из преподавателей традиционных основных дисциплин химии, физики, математики и информатики, которые разделяют общие интересы в применении своих методов к важным проблемам биологии.

Институт количественной биологии BioMaPS, дом вычислительной техники Аспирантура по биологии и молекулярной биофизике, продвигает междисциплинарные исследования и последипломное образование среди экспериментаторов и теоретиков, работающих над проблемами, охватывающими три основные области исследований, предназначенные для обеспечения многомерного представления сложных биологических систем:

* Структурная биология вычислительной и экспериментальные исследования структур и взаимодействий биомолекул с природными / синтетическими лигандами
* Системы: Геномика, Протеомика и amp; Синтетическая биология изучает генетические последовательности, белки и биомолекулярные сети
* Computational Biochemistry & Развитие трансляционной медицины & применение вычислительных инструментов для трансляционных исследований в биомедицине

Что касается структурной биологии, то основное внимание уделяется крупным биомолекулярным комплексам, связанным с регуляцией генов. Рутгерс имеет сильную традицию в области структурной биологии, о чем свидетельствует большая группа известных в мире исследователей в этой области, а также тот факт, что Рутгерс является домом Банка протеиновых данных (PDB), единственного наиболее важный репозиторий для данных биологической макромолекулярной структуры в мире.

Содержание

Исследование структурных основ для транскрипции и регуляции транскрипции, от взаимодействий ДНК с полимеразой и факторами транскрипции до исследования структуры хроматина и последствий для регуляции генов, охватило несколько BioMaPS- связанные исследовательские группы в совместных исследованиях и был основой финансируемого Институтом гранта Центра NIH P20. Используемые подходы варьируются от анализа на молекулярном уровне до методов, основанных на знаниях. В последние годы наблюдается сближение этих двух крайностей. Гибридные методы, сочетающие понимание биофизического понимания, используются для создания более интерпретируемых инструментов машинного обучения для прогнозирования межмолекулярных взаимодействий. Синергия между исследованием трехмерных структур, молекулярного моделирования и биоинформатики в контексте здания Proteomics, запланированного для кампуса Busch, создает богатую среду для передовых исследований по пограничным проблемам в структурной биологии.

Моделирование биомолекулярных сетей или системной биологии на клеточном уровне рассказывает, как сложная клеточная динамика становится возможной благодаря взаимодействию более простых компонентов, включая ферментативный контроль элементарных химических стадий. Несколько преподавателей BioMaPS, заинтересованные в нелинейной динамике, исследовали, как структуры таких сетей определяют возможное динамическое поведение, с акцентом на нетривиальные качественные предсказания, которые являются устойчивыми к уточнениям биологической модели. Применения этих инструментов варьируются от понимания регуляции метаболизма у бактерий до исследования ландшафта, в котором у эукариот происходит явно необратимое определение судьбы клеток. Возможности взаимодействия со связанными со стволовыми клетками действиями в кампусе очевидны и будут стимулировать эти усилия, чтобы обрести дальнейшую силу.

Предприятия в области вычислительной биохимии и трансляционной медицины простираются от молекулярного до клеточного до организменного уровня. Исследователи Института BioMaPS активно сотрудничают с Институтом рака Нью-Джерси, чтобы предоставить количественные инструменты для исследований рака. Предметы включают биоинформационные подходы для выявления подтипов рака, изучение биомаркеров, моделирование на тканевом уровне и изучение популяционной генетики связанных с раком SNP. Подход к трансляционным биомедицинским исследованиям с использованием современных вычислительных и математических инструментов с разных точек зрения является основной развивающейся темой Института количественной биологии BioMaPS.

Требования

* Личное заявление, официальные стенограммы, три рекомендательных письма и резюме.
* GRE General; Предпочитается предметное тестирование по математике, физике или естественным наукам.
* Пожалуйста, ответьте на следующие вопросы в своем личном утверждении:

* Есть ли научная статья или книга, которую вы прочитали, курс, который вы прошли, или другой опыт, который побудил вас продолжить аспирантуру в области вычислительной биологии & Молекулярная биофизика? Пожалуйста, кратко опишите.
* С какими тремя преподавателями вы больше всего хотите работать?

Финансирование

Всем аспирантам первого года обучения предоставляются стипендии на уровне департаментов или университетов или ассистенты выпускников, которые обеспечивают стипендию, ремиссию за обучение и иногда плату за обучение в течение первого года. После первого года студенты будут получать поддержку от своих консультантов в виде стипендий и ассистентов выпускников.

Существует также ряд многолетних стипендий для продвинутых студентов в рамках учебных программ NSF и NIH. BME также имеет ограниченное количество учебных пособий для аспирантов, которые демонстрируют выдающиеся педагогические навыки.

Подробнее

Аккредитация

Имя Rutgers узнаваемо повсюду, и степень Rutgers производит большое первое впечатление. Мы построили нашу академическую репутацию на твердых достижениях:

* Рутгерс является членом Гарвардского университета, Йельского университета и Беркли из престижной Ассоциации американских университетов, 61 ведущего исследовательского университета Северной Америки.

* Более 175 исследовательских центров Rutgers поддерживают новаторскую работу в области стволовых клеток, изменения климата, анализа ДНК и т. Д.

* Международная репутация Rutgers привлекает лучших студентов из более чем 130 стран и всех 50 штатов.