Биомедицинская информатика

Концентрация биомедицинской информатики (ИМТ) направлена ​​на эффективное использование биомедицинских данных, информации и знаний для биомедицинских и клинических исследований, а также на поддержку принятия решений в результате усилий по улучшению здоровья человека. Выпускники найдут карьеру в учебных и научно-исследовательских учреждениях учебных и медицинских учреждений; промышленность и больницы; и законодательные и правительственные регулирующие органы. Аспирантура будет состоять из разработки передовых вычислительных методов и стратегий, которые непосредственно влияют на уход за пациентами, а также клинических и биомедицинских исследований. Это междисциплинарная концентрация, совместно управляемая кафедрами биомедицинской информатики, математики и компьютерных наук, биостатистики и биоинформатики.

Студенты, допущенные к программе в полном объеме, должны обладать базовыми знаниями в области исчисления на уровне колледжа, биологии, статистики и компьютерного программирования. Могут быть приняты сильные кандидаты, которым не хватает некоторых из этих знаний (например, доктор медицинских наук без официальной подготовки в области компьютерных наук), но они должны будут пройти вводные курсы по информатике в качестве условия поступления. Аналогичные условия будут предоставлены сильным кандидатам, ориентированным на информатику, которые не имеют специальной подготовки или опыта в области биомедицины.
Студенты должны выполнить каждое из следующих требований.

• Требования к курсу:
  • 3 основных курса, 6 обязательных курсов из 3 треков и 2 факультатива (см. ниже).
  • Завершите проект по информатике и клинической ротации. Эти проекты включают междисциплинарную работу и будут совместно контролироваться основным преподавателем и преподавателем информатики или предметной области. Ожидается, что проекты будут в областях, имеющих отношение к теме диссертации студента. Студенты должны представить проектное предложение и итоговый отчет. Возможные области ротации включают информатику отделения интенсивной терапии, исследования биомедицинской информатики в ОПЗ, медицинский дом, визуализацию и радиационную терапию, моделирование и визуализацию данных, информатику трансплантации, обработку естественного языка в биомедицине.
• Квалификационные экзамены. Состоит из областного экзамена, который охватывает основополагающие материалы в области исследований студента, и предложения по диссертации, в котором студент описывает набор открытых вопросов исследования и подходы, которые будут приняты, чтобы ответить на них. < / li>
• Требования к преподаванию. Каждый учащийся должен посещать трехдневный летний семинар и семинар для одного преподавателя по семестру, совместно преподавать один курс и самостоятельно преподавать один курс для начинающих.
• Требования к этике. Каждый студент должен посетить однодневный летний семинар и посетить как минимум 4 семинара, проводимых в сотрудничестве с аспирантурой Laney и Центром этики Emory. Студенты также должны посещать минимум 6 часов программных материалов по этике (CS 590, программа обучения программ и CS 700, семинар для выпускников). CS 590 должен быть закончен осенью второго или третьего года обучения.
• Студенты должны соответствовать требованиям для проживания в аспирантуре.
• Каждый студент должен представить семинар для аспирантов, подготовить приемлемую диссертацию и выступить с устной защитой.

Требования к курсу

Студенты обязаны пройти следующие 3 основных курса:

• BMI 500: введение в биомедицинскую информатику
• CS 534: машинное обучение
• BIOS 506: биостатистические методы (4)

Кроме того, студенты должны пройти 6 курсов, которые служат строительными блоками для здоровой биомедицинской информатики. Эти курсы организованы по трем направлениям: математические основы, биомедицинские приложения и вычислительные методы. Студенты должны пройти два курса с каждого трека.
Математические основы (2 курса / минимум 6 кредитов). Цель этого курса - обеспечить обучение математическим и статистическим методам для анализа данных, формулирования и проверки гипотезы и т. Д. Примеры курсов, соответствующих этому требованию, перечислены ниже. Студенты также могут заменить другие курсы уровня магистратуры по математике, BIOS, EPI (с предварительного одобрения директора программы BMI и / или вашего научного руководителя).

• BIOS 510: теория вероятностей I
• BIOS 710: теория вероятностей II
• BIOS 511: статистический вывод I
• BIOS 711: статистический вывод II
• BIOS 522: анализ выживания
• РПИ 504: основы эпидемиологии
• ИНФОРМАЦИЯ 503: Принципы управления информатикой
• MATH 515: численный анализ I

Биомедицинские приложения (2 курса / минимум 6 кредитов). Цель этого курса - обеспечить обучение в конкретных областях, которые мотивируют методологическую и прикладную деятельность исследований в области биомедицинской информатики. Примеры курсов, которые соответствуют этому требованию, перечислены ниже. Студенты также могут заменить другие курсы для выпускников GDBBS, BMI и т. Д. (С предварительным одобрением директора программы BMI и / или вашего научного руководителя).

• IBS 523 Cancer Biology I
• IBS 524 Cancer Biology II
• IBS 534 Компьютерная нейронаука
• IBS 574 Computational Biology & Биоинформатика
• BMI 614+ Машинное обучение & Вычислительная биология
• ИМТ 615+ Биомедицинская визуализация информатики
• BMED 6760/6790 Нейронная модель информационного процесса
• BMED 6780 Обработка медицинских изображений
• BMED 6789 Technology Ventures
• BMED 7411 Математические модели в биологии & Медицина

Вычислительные методы (2 курса). Цель этого курса - обеспечить обучение вычислительным системам и методикам, которые необходимы для проведения исследований и разработок в области биомедицинской информатики. Примеры курсов, которые соответствуют этому требованию, перечислены ниже. У студентов также есть возможность заменить другие курсы уровня магистратуры из MathCS, BMI и т. Д. (С предварительным одобрением директора программы BMI и / или вашего научного руководителя.

• Системное программирование CS 551
• Системы баз данных CS 554
• CS 556 Языки программирования и компиляторы
• CS 557 Искусственный интеллект
• CS 562 Advanced Computer Systems
• CS 563 Цифровая обработка изображений
• CS 570 Data Mining
• CS 571 Обработка естественного языка
• CS 572 Поиск информации
• Конфиденциальность и безопасность данных CS 573
• Операционные системы CS 580
• Высокопроизводительные вычисления CS 581 (объединены с CS 555)
• МАТЕМАТИКА 771 Числовая оптимизация

Наконец, студенты должны пройти 2 дополнительных курса для выпускников. Чтобы выполнить это требование, студенты могут выбрать курсы по математике, информатике, биологии, химии, биомедицинской информатике, Школе общественного здравоохранения им. Роллинса, Медицинской школе и соответствующим школам в Технологическом институте Джорджии в рамках программы ARCHE. При замене курсов студент должен получить предварительное письменное разрешение от своего научного руководителя, CSI DGS и директора программы BMI.
Студенты должны завершить свои основные курсы с оценкой B + или выше и завершить оставшиеся курсовые работы к третьему году с средним баллом 3,5 или выше. Студенты могут сдать квалификационный экзамен после завершения минимальных требований курса.

• Стенограммы. Нам понадобятся копии стенограмм из каждого учебного заведения, в котором вы учились, включая ваше текущее. Они должны быть на английском языке. и выдан регистратором в вашем университете. Мы не требуем официальных протоколов (выданных регистратором в вашем университете) как часть процесса подачи заявки, только если и когда вам предложат и примут прием.
• Результаты GRE: нам потребуется отправить нам ваш официальный общий балл GRE (код учреждения 5187).
• Заявление о цели. Напишите откровенно о том, почему вы хотите получить степень доктора философии. в области компьютерных наук и информатики, над какими вопросами вы работали в прошлом, на чем вы собираетесь сосредоточиться в своих исследованиях и как вы планируете использовать опыт исследований в своем долгосрочном плане.
• Curriculum Vitae. Предоставьте документ со списком соответствующего опыта и достижений, таких как стажировки, награды и исследования, которые, как вы считаете, укрепят вашу заявку.
• рекомендательные письма; Нам требуются три специалиста, обладающие знаниями о вашей успеваемости, для написания писем, которые оценивают ваш исследовательский потенциал и ваш преподавательский опыт. Ваша заявка не может быть обработана до того, как мы получим эти письма.
• Плата за подачу заявления. Плата за подачу заявления не взимается (0 долларов США) до 31 октября (полночь по тихоокеанскому времени). С 1 ноября регистрационный взнос составляет 75 долларов США.
• Международные кандидаты, чей родной язык не является английским, также должны сдать тест по английскому языку как иностранному (TOEFL).

Стипендия

Студенты допущены к нашей кандидатской степени. Программа награждена полным обучением и конкурсной поддержкой стипендий. Дополнительная летняя поддержка и помощь в обучении могут быть доступны. Кроме того, фонды исследований, специализированного обучения и повышения квалификации доступны студентам через школу выпускников Эмори Лейни.